吗替麦考酚酯胶囊可以用于预防同种肾炎病人的排斥反应，也可以治疗难治性排斥反应，甚至也可以用环孢素和肾上腺皮质激素同时应用。
吗替麦考酚酯胶囊当患者做完移植手术之后，自身出现排斥反应，可以在医生的指导下用药，在用药期间如果出现了中性粒细胞减少的现象时，需要停止或者是减量，对于严重慢性肾功能损伤的病人，需要避免一次超过一克的量，避免用药之后导致自身的肾损伤症状加重。
吗替麦考酚酯胶囊在用药的时候容易出现免疫抑制剂方面的副作用，同时副作用发生之后并不容易明确病情，通常是由于基础病的存在，或者是多种药物联合应用之后引起的现象，但是当患者出现恶心、腹痛以及呕吐等不良反应时，可以在医师的指导下酌情减轻药物剂量。
吗替麦考酚酯胶囊在用药治疗期间需要适当的放松心情，同时还需要在短时间内给予流质饮食，避免自身的伤口愈合不利，如果患者并不能够给予流质饮食，则需要通过静脉输液的方式补充营养，可以促使自身的抗病能力增强，有利于体质的恢复。
